过了“海不扬波”石牌坊，是头门的庭院，庭院东、西侧各有一对青石华表，一对石狮子，这显示出古庙的威严与不凡气度。

　　头门两边分立着干里眼和顺风耳，黑漆大门两边介面有唐初猛将秦琼与尉迟恭的门神彩绘像。这四位神祗日夜守护着神庙，其忠心耿耿可谓是千百年来如一日。门上方是 “南海神庙”的横匾。左右对联写道:“白浪起肘浪花拍天山骨折呼吸雷风;黑云去后云芽拂锗海怀开吞吐星月。”原联由清代林子觉撰写，现联由广东省著名书法家卢有光于1991年重书。这副对联生动地绘述了南海神呼风唤雨、法力无边的神力。

　　头门东侧有韩愈碑亭，这是南海神庙保存最早的碑刻。唐宪宗元和十二年 (817年)和元和十四年 (819年)，孔子的第38代世孙孔戣来到广州祭祀南海神，并拨款修葺，扩建了庙宇，适逢唐代大文学家韩愈因《谅迎佛骨表》一事在元和十四年被贬往潮州时途经广州，孔、韩二人素来好友，且孔仰慕韩的文学才能，便请韩愈著文纪念修茸神庙之事。韩愈欣然写下了1000多字的《南海神广利王庙碑》。

　　韩愈碑高2.47米，宽为1.13米，韩愈撰文，陈谏书。韩愈碑刻对研究南海神庙的起源、发展、唐代祭海口俗及当时海上贸易往来，具有重大的参考价值。

　　头门西侧是北宋开宝碑亭。北宋开宝四年 (917年)，潘仁美率军南下，灭了南汉国，平定了岭南地区。开宝六年(919年)，北宋在广州设立市舶司，管理对外贸易，并拨款修茸南海神庙，希望能保佑海上交通、交易顺利。开宝碑亭主要记述了这段时期的祭祖及史事。